از زمانی که سیگنال های EEG ثبت شد محققین سعی در استفاده از این سیگنال ها برای کاربرد های مختلف داشتند. در ابتدای کار از این سیگنال ها فقط برای کاربرد های پزشکی استفاده می کردند مانند تشخیص انواع بیماری ها که رایج ترین آنها بیماری صرع است . اما بعد ها از این سیگنال ها نیز به منظور کمک رساندن به بیمارانی که دارای ناتوانی جسمی و عصبی هستند نیز استفاده شد. در این افراد مغز فرمان ها را صادر می کند اما به دلیل نقص در اندام این فرمان ها به طور کامل اجرا نمی شود با استفاده از BCI می توان سیستمی طراحی کرد که فرمان را مستقیما از مغز بگیرد و بر روی این سیگنال پردازش انجام دهد و عمل مورد نظر را انجام دهد.